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ecology/이론

allee effect 앨리효과, 뭉치면 좋고, 흩어지면 안좋고 :D The Allee effect is a phenomenon in biology characterized by a correlation between population size or density and the mean individual fitness of a population or species.(often measured as per capita population growth rate) The generally accepted definition of Allee effect is positive density dependence, or the positive correlation between population density and individual fit.. 더보기
[집단유전] Arlequin을 이용한 population haplotype 분석 mac osx에서는 안돌아감 / arp, hap 파일 만드는거 귀찮음 / 옵션 다 선택하면 결과 많이 나와 귀찮음 Arlequin은 이탈리아 전통희극 중의 유명한 등장인물인 "Arlecchino"의 프랑스어식 표현으로, 알레치노는 그가 원하는 대로 사물을 바꾸는 능력을 가지고 있었음. 이러한 다양한 형태로 변화시키는 그의 능력은 그의 알록달록한 의상에서도 나타나며, 이 Arlequin 프로그램의 아이콘 역시 이를 바탕으로 디자인되었음. (아마도 nucleotide polymorphism과 연관하여 해당이름을 지은 듯 ;ㅡ;) The analyses Arlequin can perform on the data fall into two main categories: intra-population and int.. 더보기
[집단유전] populations haplotype, nucleotide diversity 통계적으로 비교하는법 Does anyone has a method to test if haplotype and nucleotide diversities between samples are significantly different? - ResearchGate. https://www.researchgate.net/post/Does_anyone_has_a_method_to_test_if_haplotype_and_nucleotide_diversities_between_samples_are_significantly_different [accessed Nov 17, 2016]. 대답중 일부 Miguel Navascués · 35.13 · French National Institute for Agricultural Research Yo.. 더보기
neutral theory of molecular evolution https://en.wikipedia.org/wiki/Neutral_theory_of_molecular_evolution#The_.22neutralist.E2.80.93selectionist.22_debate Neutral theory of molecular evolutionFrom Wikipedia, the free encyclopediaFor the monograph by Kimura, see The Neutral Theory of Molecular Evolution. The neutral theory of molecular evolution holds that at the molecular level most evolutionary changes and most of the variation wit.. 더보기
cf. aff. spp. sp. ssp 의 의미 actually "cf.", "aff." are Latin abbreviations not "spp.", sp. or ssp. 사실 cf.와 aff.가 라틴어의 축약형인것은 맞지만, spp.와 sp. ssp.의 경우에는 아니다. spp. is simply the plural form of "sp." or species, correct, and ssp is subspecies. spp.는 species, 즉 sp.의 단순한 복수형이며, ssp는 아종을 의미한다. cf. is short for "confer" meaning "compare with" in the context of systematics/taxonomy = correct, but see below. cf.는 계통분류학에서 confer, com.. 더보기
conservation genetics chapter 1 introductionchapter 2 genetics and extinctionchapter 3 genetic diversitychapter 4 characterizing genetic diversity: single locichapter 5 characterizing genetic diversity: quantitative variationchapter 6 evolutionary impacts of natural selection in large populationschapter 7 evolutionary impacts of mutation and migration, and their interactions with selection in large populationschapter.. 더보기
cytochrome oxidase subunit 1 mitochondrial gene Bioedit : alignment, haplotype identification confimation Arlequin : Nei's nucleotide diversity (pi, probability that 2 randomly chosen homologous nucleotides are different) Watterson's theta (S, estimate of the population mutation rate using the no. of estimated from the infinite-site equilibrium relationship between the no. of segregating sites, the sample size and θ) AMOVA (analysis of molecu.. 더보기
phylogenetics construct a data matrixidentify a tree that i most compatible with the data matrixconduct statistical analyses to evaluate confidence ingroupoutgroupserves as a point of comparisonfor rooting of a phylogeny to determine the polarity of character change gap penaltypenalize alignments that add indelsthreshold for the no of base substitutions avoided before an indel is inferred (often 3-20) evoluti.. 더보기
개체군생태학, 류문일 이준호 서울대학교출판부 2002년 개체군생태학, 류문일 이준호 서울대학교출판부 2002년 제1장 개체군의 개념 및 특성 1.1 개체군의 개념1.2 개체군의 생태적 특성 제2장 개체군의 성장 2.1 기본 성장형2.2 성장형의 변이2.3 환경과 개체군의 성장2.4 개체군 성장의 분석2.5 단일 개체군 동태의 이론모형 제3장 개체군의 진화 3.1 접근 방향3.2 자원 및 에너지 획득3.3 에너지 할당3.4 생활사 특성 제4장 개체군간 상호작용과 공진화 4.1 종간경쟁4.2 식물과 식식자간의 상호작용4.3 포식자와 피식자(기생자와 기주) 개체군간의 상호작용4.4 공생4.5 군집의 형성 제5장 개체군 밀도변동, 조절 및 안정 5.1 서론5.2 새체군의 밀도변동, 조절 및 안정의 개념5.3 개체군의 밀도조절에 대한 이론5.4 논의의 종합과 과제 제.. 더보기
infinite alleles model, The infinite alleles model is a mathematical model for calculating genetic mutations. The Japanese geneticist Motoo Kimura and American geneticist James F. Crow (1964) introduced the infinite alleles model, an attempt to determine for a finite diploid population what proportion of loci would be homozygous. This was, in part, motivated by assertions by other geneticists that more than 50 percent .. 더보기
F-statistics F-statisticsFrom Wikipedia, the free encyclopedia http://en.wikipedia.org/wiki/F-statistics In population genetics, F-statistics (also known as fixation indices) describe the statistically expected level of heterozygosity in a population; 개체군 유전학 용어인 F-statistics(fixation indices)는 어느 한 개체군내에서의 heterozygosity에 대한 확률기대치를 의미한다. more specifically the expected degree of (usually) a reduction in hete.. 더보기
어류의 성 보호되어 있는 글입니다. 더보기
Enrichment 방법을 이용한 Microsatellite 개발, 보호되어 있는 글입니다. 더보기
R/D RATIO 보호되어 있는 글입니다. 더보기
CO1 gene, ideal barcoding gene http://www.biotechlearn.org.nz/themes/barcoding_life/the_ideal_barcoding_gene The ideal barcoding geneA gene from mitochondria, called cytochrome c oxidase subunit 1 (CO1), was selected by the Consortium for the Barcode of Life (CBOL) as the ideal gene for DNA barcoding animal species. It’s an essential gene Cellular respiration breaks down food molecules, like glucose, to release carbon dioxide.. 더보기
보전생물학 문제, 1. 보전생물학이란 최근 인간의 활동으로 인한 생물의 멸종과 환경의 파괴에 대한 위기의식으로 발전된 종합과학으로, - 지구상의 생물다양성을 조사하고, - 이들 종, 군집 및 생태계에 대한 인간의 충격을 조사하고, - 멸종을 방지하고, 종내 유전적 다양성을 유지하고 생물군집과 관련된 생태계의 기능을 보호하고 회생시키는 목적을 갖고있는 학문 2. 보전생물학의 윤리강령 - 종과 생물군집의 다양성은 보전되어야한다 - 개체군과 종의 멸절을 방지해야한다 - 생태적 복잡성은 유지되어야한다 - 진화는 계속되어야한다 - 생물다양성은 원초적가치를 지니고있다 1. 생물다양성 - 종다양성: 지구상에 존재하는 모든 종들 - 유전적다양성: 지리적 및 집단 내에 존재하는 유전자의 변이들 - 생태계다양성: 여러 종류의 생물군집과 그.. 더보기
MASATOSHI NEI, Molecular evolutionary genetics ch 1. introduction ch 2. evolutionary history of life ch 3. genes and mutation ch 4. evolutionary change of amino acid sequences ch 5. evolutionary change of nucleotide sequences ch 6. genomic evolution ch 7. genes in populations ch 8. genetic variation within species ch 9. genetic distance between populations ch 10. DNA polymorphism within and between populations ch 11. phylogenetic trees ch 12.. 더보기
Diffusion boundary layer, Diffusion boundary layer From Wikipedia, the free encyclopedia The diffusion boundary layer is a thin (usually on the scale of micrometers) layer of fluid which is not mixed with the main body of the fluid (or cellular arrangement in the case of organisms), by virtue of its proximity to the fluid's edge. In the case of flora the diffusion boundary layer is often associated with the leaf surface,.. 더보기
밤수지맨드라미, 가시수지맨드라미, 자색수지맨드라미, 검붉은수지맨드라미, 큰수지맨드라미, 분홍바다맨드라미 기재문 출처: Ewha CRL.com 출처로 가시면 생태사진도 보실수 있습니다 ;ㅡ;)b Dendronephthya castanea Utinomi, 1952 밤수지맨드라미 Anthozoa 산호충강 > Octocorallia 팔방산호아강 > Alcyonacea 해계두목 > Nephtheidae 곤봉바다맨드라미과 >Dendronephthya 수지맨드라미속 Dendronephthya castanea Utinomi, 1952; p. 203, text-fig. 26, pl. 10, fig. 19; 1962, p. 107; Rho & Song, 1977, p. 94, text-fig. 8, pl. 2, fig. 4; Song, 2000, p. 167; Song & Lee, 2000, p. 1; Lee & Song, 20.. 더보기
해송, 긴가지해송, 이엽해송 기재문 출처: Ewha CRL.com 출처로 가시면 생태사진도 보실수 있습니다 ;ㅡ;)b Antipathes japonica Brook, 1889 해송 Anthozoa 산호충강 > Ceriantipatharia 꽃말미잘아강 > Antipatharia 각산호목 > Antipathidae 해송과 > Antipathes 해송속 Antipathes bifaria Brook, 1889, p. 170, pl. 11, fig. 20; Opresko, 1974, p. 49. Antipathes (Euantipathes) japonica van Pesch, 1914, p. 50, text-figs. Antipathes japonica Brook, 1889, p. 169, pl. 11, fig. 25; Silberfeld, 19.. 더보기

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